Wenn die Beschriftung nur so breit wie das Bild sein soll, dann kannst Du sie in eine `\parbox` der entsprechenden Breite setzen. In der kann man dann auch eine Einstellung für die Schrift vornehmen. Wenn die Beschriftung auch mehrere Zeilen enthalten kann, dann kann man sie nicht mehr einfach in den ausreichend großen Zwischenraum zwischen den Bildern einfügen, sondern muss ihre Höhe explizit berücksichtigen. Dazu werden mit `nodes={anchor=south}` die Nodes an ihrem `south` Anker ausgerichtet. Dann werden auch nicht mehr die `center` Anker der Nodes verbunden, sondern die Punkte, die eine halbe Bildhöhe über dem `south` Anker liegen. In der letzten Zeile müssen die Nodes für die Endpunkte der Verbindungen dann eine entsprechende Höhe bekommen. Dafür wird an den Stellen eine Stütze über den neu definierten Befehl `\LV` eingefügt.
\documentclass[DIV=21,12pt,captions=tableheading]{scrreprt}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{matrix}
\newlength\bildhoehe
\setlength\bildhoehe{2cm}
\newcommand\bildbreite{2cm}
\newcommand\schrift{\footnotesize}% Einstellung für Bildbeschriftungen
\newcommand\zeilenabstand{.75\tabcolsep}
\newcommand\grafik[2]{%
\begin{minipage}{\bildbreite}
\centering\raisebox{.5\tabcolsep}{%
\parbox[b]{\linewidth}{\hspace*{0pt}\raggedright\schrift#1}}\newline%
\includegraphics[width=\linewidth,height=\bildhoehe]{#2}%
\end{minipage}%
}
\newcommand\LV{\rule{0pt}{0.5\bildhoehe}}% Stütze, liefert nötige Höhe für Endpunkte
\tikzset{vp/.style={circle,fill,inner sep=3pt}}
\newcommand\verbindungslinie[3]{
\foreach [remember=\p as \lastp (initially #2)] \p in {#3}
\draw[#1]([yshift=.5\bildhoehe]\lastp.south)node[vp]{}--([yshift=.5\bildhoehe]\p.south)node[vp]{};
}
\usepackage{mwe}% für example-image
\begin{document}
\begin{center}
\begin{minipage}{\linewidth}
\captionof{table}{Morphologischer Kasten}\label{morphKasten}
\begin{tikzpicture}[
very thick,
nodes={inner sep=\tabcolsep}
]
\matrix[
matrix of nodes,
inner sep=0pt,
nodes={anchor=south},
row sep=\zeilenabstand,
column 1/.style={text width={2\tabcolsep+1em},align=right,yshift=0.5\bildhoehe},
column 2/.style={minimum width=4.5cm,yshift=0.5\bildhoehe}
](m){
1&Teilfunktion 1
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}\\
2&Teilfunktion 2
&\grafik{längerer Text}{example-image}
&\grafik{Beispielbild}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}\\[\tabcolsep]% wegen der Linie
\ldots&{}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Bild mit sehr langem Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}\\
n&Teilfunktion n
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}
&\grafik{Text}{example-image}\\
&&\LV&&\LV&\LV\\
&&\LV&\LV&\LV&\LV\\
};
% Kopfzeile
\node(ul)[anchor=south west]
at ([yshift={\zeilenabstand+\aboverulesep+\belowrulesep}]m.north west)
{Teilfunktion};
\node(or)[anchor=south east] at (ul.north-|m-1-2.east){Lösungsvarianten};
\foreach[count=\i from 3] \c in {1,2,\ldots,m}
\node[anchor=base] at (or.base-|m-1-\i){\c};
% Tabellenlinien
\draw[line width=\lightrulewidth](or.north-|ul.west)--(or.east|-ul.south)
([yshift=-\aboverulesep]ul.south-|m.west)
--([yshift=-\aboverulesep]ul.south-|m.east);
\draw[line width=\heavyrulewidth]([yshift=\belowrulesep]or.north-|m.west)
--([yshift=\belowrulesep]or.north-|m.east)
([yshift={-\aboverulesep-\zeilenabstand}]m.south west)
--([yshift={-\aboverulesep-\zeilenabstand}]m.south east);
% Verbindungslinien
\verbindungslinie{red}{m-1-3}{m-2-4,m-3-3,m-4-5,m-5-5}
\verbindungslinie{blue}{m-1-5}{m-2-3,m-3-3,m-4-3,m-5-3}
\verbindungslinie{green}{m-1-6}{m-2-6,m-3-4,m-4-6,m-5-6}
\foreach \f/\p/\t in {red/m-5-5/LV1,blue/m-5-3/LV2,green/m-5-6/LV3}
\node[\f,below,font=\bfseries]at(\p){\t};
% vertikale Beschriftung und Tabellenzwischenlinie
\path(m-1-1.north west)--
node[xshift=\zeilenabstand,rotate=90]{Beschriftung}
(m-2-1.south west);
\draw[line width=\lightrulewidth]([yshift=-\tabcolsep]m.west|-m-2-3.south)--([yshift=-\tabcolsep]m.east|-m-2-3.south);
\end{tikzpicture}
\end{minipage}
\end{center}
\end{document}
![alt text][1]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/morphkastneu.png