`\item` hat bei allen Listen ein optionales Argument, so auch bei `enumerate`:
\documentclass[a5paper,11pt]{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\begin{document}
\section{Spezialgesetze des Bundes zur Gefahrenabwehr}
\begin{enumerate}
\item die auswärtigen Angelegenheiten sowie die Verteidigung einschließlich des Schutzes der
\item[3.] das Paßwesen, das Melde- und Ausweiswesen
\end{enumerate}
\end{document}
Es ist allerdings darauf zu achten, dass im Fall der Verwendung des optionalen Arguments die interne Aufzählungsnummer nicht hochgezählt wird und deshalb der nächste Aufzählungspunkt ohne optionales Argument nicht automatisch 4, sondern 2 wäre. Ebenso würde ein `\label` nach `\item[3.]` nicht auf 3, sondern (im Beispiel) weiterhin auf 1 verweisen.
Man kann sich aber natürlich eine eigene Item-Anweisung definieren, bei der das optionale Argument tatsächlich den Wert für die interne Aufzählungsnummer ändert:
\documentclass[a5paper,11pt]{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\makeatletter
\newcommand*{\nextenum}[1]{\setcounter{\@enumctr}{#1}\addtocounter{\@enumctr}{-1}}
\makeatother
\newcommand*{\eitem}[1][]{
\if\relax\detokenize{#1}\relax\else\nextenum{#1}\fi\item}
\begin{document}
\section{Spezialgesetze des Bundes zur Gefahrenabwehr}
\begin{enumerate}
\eitem die auswärtigen Angelegenheiten sowie die Verteidigung einschließlich des Schutzes der
\eitem[3] das Paßwesen, das Melde- und Ausweiswesen\label{aber}
\eitem und hier geht es nach \ref{aber} ganz normal weiter
\end{enumerate}
\end{document}
Durch Mischung von `\item` und `\eitem` kann man notfalls auch eingeschobene Punkte wie 3a erreichen:
\documentclass[a5paper,11pt]{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\makeatletter
\newcommand*{\nextenum}[1]{\setcounter{\@enumctr}{#1}\addtocounter{\@enumctr}{-1}}
\makeatother
\newcommand*{\eitem}[1][]{
\if\relax\detokenize{#1}\relax\else\nextenum{#1}\fi\item}
\begin{document}
\section{Spezialgesetze des Bundes zur Gefahrenabwehr}
\begin{enumerate}
\eitem die auswärtigen Angelegenheiten sowie die Verteidigung einschließlich des Schutzes der
\eitem[3] das Paßwesen, das Melde- und Ausweiswesen\label{aber}
\item[3a] und hier geht es mit einem a nach der \ref{aber} weiter
\end{enumerate}
\end{document}
Dann gilt aber natürlich für diesen Punkt wieder die Einschränkung bezüglich `\label`.`\label`.
Übrigens bietet sich für Verträge, Gesetze etc. auch die Verwendung des Pakets [`scrjura`](http://www.ctan.org/pkg/scrjura) an, das in Zusammenarbeit zwischen einem Juristen und dem KOMA-Script-Autor speziell für solche Dinge geschaffen wurde, eine automatische Absatznummerierung bietet und dabei auch die Möglichkeit kennt, Absätze zu überspringen. Das Paket ist im [KOMA-Script-Buch](http://www.komascript.de/komascriptbuch) ausführlich dokumentiert. Eine freie Kurzanleitung existiert außerhalb der KOMA-Script-Anleitung ebenfalls.