Also für die erste Frage bin ich soeben nach stundenlanger Suche selbst auf eine Antwort gestoßen:
Mit:
\begin{tikzpicture}[trim axis left,trim axis right]
kann der Bereich des Diagramms offenbar so beschnitten werden, dass die Ausrichtung horizontal wieder passt. Mehr dazu hier:
[http://www.golatex.de/pgfplots-untereinander-ausrichten-pgfplots-profis-hier-t5479.html][1]
- Die Frage nach der Schriftgröße (sieht aus wie "fett") ist weiterhin unbeantwortet.
- Die 1000er-Trennzeichen kann ich ebenfalls noch nicht entfernen
[1]: http://www.golatex.de/pgfplots-untereinander-ausrichten-pgfplots-profis-hier-t5479.html