Das Problem kann bei `longtable` eigentlich nur auftreten, wenn man es (entgegen der Anleitung) versäumt, den Kopf der Tabelle als solchen zu deklarieren. Tut man dies, `longtable` geht nämlich bei deklariertem Kopf sinnvoller Weise davon aus, dass der Kopf immer komplett auf der Seite stehen soll. Daher verschwindet das Problem:
Problem, durch die Deklaration des Kopfes:
\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{longtable}
\usepackage{booktabs}
\newcommand*{\thtext}[1]{\textbf{#1}}
\usepackage{mwe}
\begin{document}
\lipsum[1-5]
Und jetzt kommt gleich die Tabelle:
\begin{longtable}{*4l}
\bottomrule
\endlastfoot
\endlastfoot% Ende des Fußes ganz am Ende der Tabelle
\caption{Zusammenfassung} \\
\toprule
\thtext{Master-Task} & \thtext{Tasks mit identem } & \thtext{Kommentar} & \textbf{gruppe} \\ \midrule
\endfirsthead% WICHTIG
Anfang des Kopfes ganz am Anfang der Tabelle
FKM\_gws & KM\_gws & KM Assessment & gws\\
& KM\_ga & KM Assessment & ga\\
& KM\_aw2 & KM Assessment & aw2\\ \midrule
KM\_aws & KM\_aws & FKM Assessment & aws\\
& KM\_bav & KM Assessment & bav\\
& KM\_bar & KM Assessment & bar\\
& KM\_sb & KM Assessment & sb\\
& KM\_en & KM Assessment & en\\ \midrule
KM\_ebr & KM\_ebr & KM Assessment & ebr\\
& KM\_eba & KM Assessment & eba\\
& KM\_ebs & KM Assessment & ebs\\
& KM\_pl & KM Assessment & pl\\ \midrule
KM\_st & KM\_st & FKM Assessment & st\\
& KM\_st2 & KM Assessment & st2\\
& KM\_enmax & KM Assessment & enmax\\ \midrule
FKM\_gws & KM\_gws & KM Assessment & gws\\
& KM\_ga & KM Assessment & ga\\
& KM\_aw2 & KM Assessment & aw2\\ \midrule
KM\_aws & KM\_aws & FKM Assessment & aws\\
& KM\_bav & KM Assessment & bav\\
& KM\_bar & KM Assessment & bar\\
& KM\_sb & KM Assessment & sb\\
& KM\_en & KM Assessment & en\\ \midrule
KM\_ebr & KM\_ebr & KM Assessment & ebr\\
& KM\_eba & KM Assessment & eba\\
& KM\_ebs & KM Assessment & ebs\\
& KM\_pl & KM Assessment & pl\\ \midrule
KM\_st & KM\_st & FKM Assessment & st\\
& KM\_st2 & KM Assessment & st2\\
& KM\_enmax & KM Assessment & enmax\\ \midrule
FKM\_gws & KM\_gws & KM Assessment & gws\\
& KM\_ga & KM Assessment & ga\\
& KM\_aw2 & KM Assessment & aw2\\ \midrule
KM\_aws & KM\_aws & FKM Assessment & aws\\
& KM\_bav & KM Assessment & bav\\
& KM\_bar & KM Assessment & bar\\
& KM\_sb & KM Assessment & sb\\
& KM\_en & KM Assessment & en\\ \midrule
KM\_ebr & KM\_ebr & KM Assessment & ebr\\
& KM\_eba & KM Assessment & eba\\
& KM\_ebs & KM Assessment & ebs\\
& KM\_pl & KM Assessment & pl\\ \midrule
KM\_st & KM\_st & FKM Assessment & st\\
& KM\_st2 & KM Assessment & st2\\
& KM\_enmax & KM Assessment & enmax\\ \midrule
FKM\_gws & KM\_gws & KM Assessment & gws\\
& KM\_ga & KM Assessment & ga\\
& KM\_aw2 & KM Assessment & aw2\\
\end{longtable}
\end{document}
Zum Vergleich, einfach Da hier die Tabellenüberschrift zusammen mit dem eigentlichen Tabellenkopf als Kopf des ersten Teils der Tabelle deklariert wurde, bleiben diese Teile immer zusammen und `longtable` bemüht sich außerdem, sie nicht alleine auf eine Seite zu stellen. Dasselbe gilt für die untere Linie der Tabelle, die mit `% WICHTIG` markierte Zeile auskommentieren. Dann tritt `\endlastfoot` als Ende der Umbruch wieder innerhalb des Kopfes auf.Tabelle deklariert wurde.
Neben `\endfirsthead` und `\endlastfoot` gibt es auch noch `\endhead` und `\endfoot`. Siehe dazu die Anleitung zum Paket [`longtable`](http://www.ctan.org/pkg/longtable). Innerhalb der Tabelle kann man übrigens Umbrüche mit `\pagebreak`, `\nopagebreak` und den Sternformen `\\*` bzw. `\tabularnewline*` zusätzlich beeinflussen. Siehe auch dazu die Anleitung.
