Wenn man die Option `appendixprefix = true` weglässt, kann man sich den Befehl `\appendixmore` so definieren, dass ab Beginn des Anhanges die Kapitelnummern entsprechend formatiert werden. Dafür gibt es sogar ein Beispiel in der [Doku][1], [KOMA-Srript Dokumentation][1], in dem nur noch `\autodot` durch den gewünschten Doppelpunkt ersetzt werden muss.
Wenn Du am Ende der anderen Gliederungsnummern tatsächlich keinen Punkt möchtest, brauchst Du außerdem noch die Option `numbers=noenddot`.
\documentclass[
ngerman,
numbers=noenddot
]{scrreprt}
\newcommand*{\appendixmore}{% siehe Doku
\renewcommand*{\chapterformat}{%
\appendixname~\thechapter:\enskip}%
}
\usepackage{blindtext}
\begin{document}
\blinddocument
\appendix
\blinddocument
\end{document}
![alt text][2]
[1]: http://mirrors.ctan.org/macros/latex/contrib/koma-script/doc/scrguide.pdf
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/tw_appm.png