Nachfolgende Ausführungen haben das Problem, zumindest bei mir, gelöst.
**Warnung** Ich bin kein Profi und übernehme keine Gewähr für nachfolgende Ausführungen.
Diese Ausführungen basieren auf der oben verlinkten [Dokumentation von Herbert Schulz][1].
1.) Öffne die Spotlight Suche (`cmd+Leertaste`).
2.) Gebe Texshop ein und öffne es.
3.) Klicke oben Links auf `Texshop` und klicke dann auf `Einstellungen`.
4.) Nun klicke auf den Reiter `Programme`.
5.) Nun ersetzt du im Feld (pdf)TeX `/usr/texbin` durch `/Library/TeX/texbin`
6.) Klicke auf `OK`
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1.) Öffne die Spotlight Suche und gebe nun `Latexit` ein.
2.) Gehe oben Links auf `LaTeXiT` und öffne erneut `Einstellungen`
3.) Klicke nun auf das Symbol `Pfadaufstellungen`
4.) Klicke auf den Reiter `pdflatex`. Ersetze im Feld pdfLaTeX `/usr/texbin/pdflatex` durch `/Library/TeX/texbin/pdflatex`
5.) Klicke auf den Reiter `xelatex`.Ersetze im Feld XeLaTeX `/usr/texbin/xelatex` durch `/Library/TeX/texbin/xelatex`
6.) Klicke auf den Reiter `latex+dvipdf`. Setze auch hier in das Feld `LaTeX` `/Library/TeX/texbin/latex` ein.
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1.) Öffne Spotlight und gebe `Bibdesk` ein.
2.) Gehe oben links auf `BibDesk`, klicke auf `Einstellungen` und dann auf `TeX Vorschau`.
3.) Setze nun im Feld `Pfad zu pdflatex`, `/Library/TeX/texbin/pdflatex` ein.
4.) Setze nun im Feld `Pfad zu bibtex`, `/Library/TeX/texbin/bibtex` ein.
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1.) Öffne Spotlight und gebe `Tex Live Utility` ein.
2.) Klicke oben auf `TeX Live Utility` und dann auf `Preferences`
3.) Nun klickst du auf `Choose...`
4.) Drücke nun `Shift+cmd+G` und gebe nun `/Library/TeX` ein.
5.) Doppelklick auf `texbin`
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Ich benutze TeXMaker:
1.) Öffne TeXMaker.
2.) Klicke auf `Optionen` und dann auf `Texmaker konfigurieren`
3.) Links auf `Befehle` klicken
4.) Im Feld LaTeX `"/Library/TeX/texbin/latex"` einsetzen
5.) Im Feld PdfLaTeX `"/Library/TeX/texbin/pdflatex"` einsetzen
6.) Im Feld XeLaTex `"/Library/texbin/xelatex"` einsetzen.
Bei mir funktioniert es nun.
[1]: http:/https://tug.org/mactex/UpdatingForElCapitan.pdfhttps://tug.org/mactex/UpdatingForElCapitan.pdf