Prinzipiell kann `bibtex` mehrere `bib`-Dateien verarbeiten, wenn diese als Komma separierte Liste bei `\bibliography` angegeben werden. `bibtex` behandelt diese dann genauso als wären sie zusammen eine einzige Datei. Das bedeutet insbesondere, dass die Schlüssel über alle Dateien eindeutig sein müssen und dass auch nur ein einziges Verzeichnis erzeugt wird:
\begin{filecontents}{\jobname-a.bib}
@misc{froma,
author={A Autor},
title={From A}
}
@misc{froma1,
author={C Autor},
title={Also from A},
}
\end{filecontents}
\begin{filecontents}{\jobname-b.bib}
@misc{fromb,
author={B Autor},
title={From B}
}
\end{filecontents}
\documentclass{article}
\usepackage{natbib}
\bibliographystyle{natdin}
\begin{document}
\nocite{*}
\bibliography{\jobname-a,\jobname-b}
\bibliography{\jobname-a,\jobname-b}% Achtung: Keine Leerzeichen im Argument der Anweisung!
\end{document}
Ergibt:
![Ein Verzeichnis aus zwei Literaturdatenbanken][1]
Manchmal ist das genau richtig, manchmal auch nicht.
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test6_9.png