In Deinem Beispiel sind mehrere Fehler. Zum einen gibt es das Tabellen-Präambel-Token `:` normalerweise nicht. Will man dieses verwenden, benötigt man also ein Zusatzpaket, das es definiert. Üblicherweise ist dies das Paket [`arydshln`](http://www.ctan.org/pkg/arydshln), zu dem allerdings zu erwähnen ist, dass es mit manch anderem Paket inkompatibel ist.
Desweiteren verwendest Du `fraction-function=\sfrac` als Option beim Laden von `siunitx`. Allerdings ist `\sfrac` in Deinem Beispiel nicht definiert. Daher führt auch das zu einem Fehler. Damit das funktioniert, muss beispielsweise das Paket [`xfrac`](http://www.ctan.org/pkg/xfrac) vor `siunitx` geladen werden.
Erst nach diesen Änderungen ist Dein Beispiel lauffähig. Optimal ist es dann aber noch nicht, weil die vertikalen Linien bei den `\multicolumn`-Anweisungen *hüpfen*. Es sei darauf hingewiesen, dass bis auf eine vertikale Linie vor der ersten Spalte alle vertikale Linien *nach* der jeweiligen Spalte zu deklarieren sind, als in der Regel `c|` und nicht `|c` oder `|c|`. Ich werde eine entsprechende Korrektur der `\multicolumn`-Anweisungen im ersten Beispiel weiter unten zeigen.
Ersetzt man dann bis auf die erste Spalte alle Spalten durch `S`-Spalten ergibt sich das Problem, dass in der zweiten Tabellenzeile gar keine Zahlen, sondern Texte verwendet werden. Der Versuch diese als Zahl zu interpretieren, führt dann zu einem weiteren Fehler. Die `siunitx`-Anleitung empfiehlt für diesen Fall, durch zusätzliche geschweifte Klammern `siunitx` dabei zu unterstützen, diese Einträge nicht als Zahlen interpretieren zu wollen.
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{array}
\usepackage{arydshln}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{|c|S:S|S:S:S|S:S|}
& \multicolumn{2}{c|}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c|}{Kinetik} & \multicolumn{2}{c|}{GST-Aktivität}\\
& [\SI{}{\micro\gram\per\milli\liter}] & {SD} & {$\Delta E$} & {$\Delta t$} [\SI{}{\second}] & {$R^2$} & [\SI{}{\nano\katal\per\milli\gram}] & {SD} \\\hline
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\\hdashline
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\\hdashline
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\\hdashline
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\\hdashline
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
![Tabelle mit Text und Zahlen][1]
Eine Alternative wäre übrigens, die entsprechenden Einträge mit `\multicolumn1c{…}` zu setzen. Einfach nur geschweifte Klammen zu verwenden, ist aber einfacher.
Wie Du siehst, hat das Problem also nichts mit den `\multicolumn` in der Zeile davor zu tun. Ich empfehle daher, künftig Beispiele nach der [Minimalbeispiel-Anleitung](http://texwelt.de/wissen/fragen/569/was-ist-ein-vollstandiges-minimalbeispiel-oder-kurz-vm-und-wie-erstelle-ich-dieses) weiter zu minimieren. Dabei wäre Dir auch aufgefallen, dass Du einige Pakete wie `dcolumn` problemlos hättest weglassen können, andere wie `xfrac` aber unbedingt benötigt werden.
---
Es sei an dieser Stelle noch darauf hingewiesen, dass die Hauptleserichtung einer Tabelle horizontal ist (oder zumindest sein sollte). Vertikale Linien stören dabei sehr. Daher ist es meist günstiger, so wenig vertikale Linien wie möglich – im Idealfall gar keine – zu verwenden. Auch die horizontalen Linien sollte man auf ein sinnvolles Maß reduzieren. Die Verwendung gestrichelter Linien deutet fast immer auf Linien hin, die man genauso gut weglassen könnte. Lässt man alle vertikalen Linien weg, ergibt auch das Laden von `booktabs` wieder einen Sinn:
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{booktabs}
\usepackage{array}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{cSSSS[table-format=3.0]SSS}
\toprule
& \multicolumn{2}{c}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c}{Kinetik} &
\multicolumn{2}{c}{GST-Aktivität}\\
& [\SI{}{\micro\gram\per\milli\liter}] & {SD} & {$\Delta E$} &
{$\Delta t$} [\SI{}{\second}] & {$R^2$} &
[\SI{}{\nano\katal\per\milli\gram}] & {SD} \\
\midrule
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190 \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
![Schöne Tabelle][2]
Diese Tabelle ist nicht nur schöner, sie ist auch besser zu lesen.
Es sei allerdings noch darauf hingewiesen, dass das Setzen von Einheiten in eckigen Klammern nach SI falsch ist, da die eckigen Klammern die Bedeutung *Einheit von* haben. Gemeint ist hier aber offenbar *in der Einheit* oder schlicht *in*. Leider sieht man das häufig falsch. Korrekt wäre also beispielsweise `$\Delta{t}$ in \si{\second}` oder einfach `$\frac{\Delta t}{\si{\second}}$`. Das könnte dann beispielsweise zu folgender Tabelle führen, bei der ich auch noch die Zahlenformatierung etwas optimiert und für die erste Spalte `l` statt `c` verwendet habe:
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{booktabs}
\usepackage{array}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\show\sfrac
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{lS[table-format=3.1]SS[table-format=1.3]S[table-format=3.0]S[table-format=1.3]S[table-format=1.3]S[table-format=1.3]}
\toprule
& \multicolumn{2}{c}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c}{Kinetik} &
\multicolumn{2}{c}{GST-Aktivität}\\
& \si{\micro\gram\per\milli\liter} & {SD} & {$\Delta E$} &
{$Delta t$ in \si{\second}} & {$R^2$} &
\si{\nano\katal\per\milli\gram} & {SD} \\
\midrule
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190 \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
![semantisch korrekte Tabelle][3]
@Johannes regt an, die Spaltenabstände zwischen den drei durch die `\multicolumn`-Anweisungen in der ersten Tabellenzeile bestimmten Blöcke zu variieren. Ich bin zwar der Meinung, dass auch ohne dies deutlich genug ist, welche Spalten zu welcher Überschrift gehören, aber wenn man will, kann man das natürlich machen:
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{booktabs}
\usepackage{array}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{lS[table-format=3.1]S[table-format=3.2]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=3.0]S[table-format=1.3]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=1.3]}
\toprule
& \multicolumn{2}{c@{\qquad}}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c@{\qquad}}{Kinetik} &
\multicolumn{2}{c}{GST-Aktivität}\\
& \si{\micro\gram\per\milli\liter} & {SD} & {$\Delta E$} &
{$\Delta t$ in \si{\second}} & {$R^2$} &
\si{\nano\katal\per\milli\gram} & {SD} \\
\midrule
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190 \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
![mehr Abstand zwischen den Blöcken][4]
Manchmal verwendet man in solchen Fällen auch gerne zusätzliche horizontale Linien:
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{booktabs}
\usepackage{array}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{l@{\qquad}S[table-format=3.1]S[table-format=3.2]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=3.0]S[table-format=1.3]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=1.3]}
\toprule
& \multicolumn{2}{c@{\qquad}}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c@{\qquad}}{Kinetik} &
\multicolumn{2}{c}{GST-Aktivität}\\
\cmidrule(r{1.8em}){2-3}
\cmidrule(r{1.8em}){4-6}
\cmidrule{7-8}
& \si{\micro\gram\per\milli\liter} & {SD} & {$\Delta E$} &
{$\Delta t$ in \si{\second}} & {$R^2$} &
\si{\nano\katal\per\milli\gram} & {SD} \\
\midrule
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190 \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
Ich persönliche finde das Ergebnis aber nicht schön und die Trennung von Zusammengehörendem eher ungünstig und würde in diesem Fall eher empfehlen, die Linie unter dem Tabellenkopf zu unterbrechen:
\documentclass[a4paper,12pt,headsepline,captions=tableabove,% der Klasse
% mitteilen, dass mit Tabellenüberschriften
% statt Tabellenunterschriften gearbeitet
% wird.
]{scrreprt}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[scaled]{helvet}% Wirklich Helvetica mit Latin Modern mischen???
\usepackage{booktabs}
\usepackage{array}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{xfrac}
\usepackage[locale=DE, per-mode=symbol,fraction-function=\sfrac]{siunitx}
\begin{document}
\begin{table}[ht]% h alleine ist wenig sinnvoll
\small
\centering
\caption[Ergebnisse Versuch 3]{Berechnete Werte für den Proteingehalt und die GST-Aktivität}
\label{tab:Ergebnisse}
\begin{tabular}{l@{\qquad}S[table-format=3.1]S[table-format=3.2]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=3.0]S[table-format=1.3]@{\qquad}S[table-format=1.3]S[table-format=1.3]}
\toprule
& \multicolumn{2}{c@{\qquad}}{Proteingehalt} & \multicolumn{3}{c@{\qquad}}{Kinetik} &
\multicolumn{2}{c}{GST-Aktivität}\\
& \si{\micro\gram\per\milli\liter} & {SD} & {$\Delta E$} &
{$\Delta t$ in \si{\second}} & {$R^2$} &
\si{\nano\katal\per\milli\gram} & {SD} \\
\cmidrule(l{-\tabcolsep}r{1.7em}){2-3}
\cmidrule(l{-\tabcolsep}r{1.7em}){4-6}
\cmidrule(l{-\tabcolsep}){7-8}
Kontrolle & 539,8 & 35,18 & 0,182 & 275 & 0,997 & 2,173 & 0,143 \\
V1 (1:100) & 569,2 & 90,01 & 0,160 & 275 & 0,998 & 1,809 & 0,299 \\
V2 (1:50) & 506,6 & 102,4 & 0,157 & 275 & 0,998 & 1,994 & 0,434 \\
V3 (1:20) & 596,5 & 34,33 & 0,234 & 275 & 0,991 & 2,522 & 0,146 \\
V4 (1:10) & 453,9 & 37,08 & 0,162 & 275 & 0,996 & 2,295 & 0,190 \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}
![unterbrochene Kopfline][5]
Weitere Alternativen sind beispielsweise Spiegelstriche im Kopftext oder farbig hinterlegte Blöcke mit `\columncolor` und Pakete [`xcolor`](http://www.ctan.org/pkg/xcolor) und dessen Option `table`.
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test40_1.png
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test41_1.png
[3]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test42_1.pnghttp://texwelt.de/wissen/upfiles/test42_1.png
[4]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test43_1.png
[5]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test44_1.png