Eigentlich sehe ich da kein Problem, denn der *node* wird ja trotzdem gezeichnet und ist auch zu sehen, nur eben hinter der Fläche. Fläche:
![Z6 im Hintergrund][1]
Aber wenn *nodes* später gezeichnet werden sollen, dann verschiebe eben ihre Ausgabe weiter nach hinten. Es genügt ja, zunächst die Koordinaten festzulegen, beispielsweise:
\documentclass[border=1mm]{standalone}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{intersections,angles,quotes,calc,through}
\begin{document}
\begin{tikzpicture} [
font=\footnotesize,
label distance=.05cm
]
\clip (-0.5,-1.5) rectangle (16,15);
\path
% Grundfläche
(0,0) coordinate(G1) % links vorne
(10,0) coordinate(G2) % rechts vorne
(15,5) coordinate(G3) % rechts hinten
(5,5) coordinate(G4) % links hinten
% senkrechte Fläche
(4,4) coordinate(E1) % links mitte
(14,4) coordinate(E2) % rechts unten
(14,7.5) coordinate(E3) % rechtsoben oben
(4,7.5) coordinate(E4) % links oben
% alle Z's...
(9.5,5) coordinate(Z') node[label=right:Z']{}
($(Z') + (0,3)$) coordinate(Z1) node[label=right:$Z\textsubscript{1}$]{}
($(Z') + (0,2.3)$) coordinate(Z2) node[label=right:$Z\textsubscript{2}$]{}
($(Z') + (0,1.5)$) coordinate(Z3) node[label=right:$Z\textsubscript{3}$]{}
($(Z') + (0,1)$) coordinate(Z4) node[label=right:$Z\textsubscript{4}$]{}
($(Z') + (0,0.4)$) coordinate(Z5) node[label=right:$Z\textsubscript{5}$]{}
($(Z') - (0,3)$) coordinate(Z6) % node[label=right:$Z\textsubscript{6}$]{}
node[label=right:$Z\textsubscript{6}$]{}% hier nur die Koordinate festlegen
;
\draw
% Rahmen vordere Fläche
(G1) -- (E1)
(G2) -- (G3)
% Senkrechte Fläche
(E1) -- (E2) -- (E3) -- (E4) -- cycle
(Z1) -- (Z')
;
\draw[line width=0.15mm, dashed]
% Verlängerung Seiten
(G3) -- ($(G3)!-1.5cm!(G2)$)
(E1) -- (G4)
(G4) -- ($(G4)!-1.5cm!(E1)$)
;
\draw[dashed]
% Mittellinie
(Z') -- ($(Z')!-5cm!(Z1)$)
(Z1) -- ($(Z1)!-1.5cm!(Z')$)
;
\draw[fill=gray!15,opacity=0.5] (E1)--(G1)--(G2)--(E2);
\draw[fill=gray!50,opacity=0.3] (E4)--(E1)--(E2)--(E3);
\draw[fill=white] (Z') circle [radius=.1em];
\draw (Z6) node [label=right:$Z\textsubscript{6}$] {};
{};% Kann man so natürlich auch mit den restlichen Zs machen
\end{tikzpicture}
\end{document}
![Z6 im Vordergrund][2]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test_20170817_135203.png
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test_20170817_134750.png