Dein Hauptproblem ist, dass Du mit `\multicolumn` den Spaltentyp für die Abbildungen in `c` änderst. Damit sind es kein `m`-Spalten mehr und die Grundlinie der Spalte bleibt unten statt in der Mitte. Die Lösung besteht also darin, den Text der ersten Spalte abhängig von der Höhe der anderen Spalten (die man im Beispiel sehr einfach ermitteln kann) vertikal zu verschieben:
\documentclass{article}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{ragged2e}
\begin{document}
\begin{table}[htb]
\scriptsize
% \renewcommand*{\tabularxcolumn}[1]{m{#1}}% Braucht man im Beispiel nicht,
% geht aber auch.
\begin{tabularx}{\linewidth}{l*4{>{\Centering}X}}
\toprule
\raisebox{.5\dimexpr .75cm-\ht\strutbox\relax}{\textbf{A}} & \multicolumn{2}{|c|}{\includegraphics[height=.75cm]{example-image-b}} & \multicolumn{2}{c}{\includegraphics[height=.75cm]{example-image-b}} \\
\midrule
\textbf{B} &test&test&test&test \\
\textbf{C} &test&test&test&test \\
\textbf{D} &test&test&test&test \\
\midrule
E & & & & \\
\bottomrule
\end{tabularx}
\end{table}
\end{document}
Ich habe nicht getestet, ob das so Diese Lösung funktioniert auch mit `tabu` funktioniert, gehe aber davon aus.[`tabu`](https://ctan.org/pkg/tabu):
\documentclass{article}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{tabu}% → https://github.com/tabu-issues-for-future-maintainer/tabu
\begin{document}
\begin{table}[htb]
\scriptsize
\begin{tabu} to \linewidth {X[-1,l,m]X[1,c,m]X[1,c,m]X[1,c,m]X[1,c,m]}
\toprule
\raisebox{.5\dimexpr .75cm-\ht\strutbox\relax}{\textbf{A}} & \multicolumn{2}{|c|}{\includegraphics[height=.75cm]{example-image-b}} & \multicolumn{2}{c}{\includegraphics[height=.75cm]{example-image-b}} \\
\midrule
\textbf{B} &test&test&test&test \\
\textbf{C} &test&test&test&test \\
\textbf{D} &test&test&test&test \\
\midrule
E & & & & \\
\bottomrule
\end{tabu}
\end{table}
\end{document}
Ob man das Paket trotz der unter https://github.com/tabu-issues-for-future-maintainer/tabu angesprochenen Problematik verwenden will, muss jeder selbst entscheiden. Für die gezeigte Tabelle ist das Paket jedenfalls nicht zwingend erforderlich, wie das erste Beispiel in dieser Antwort zeigt.