So mache ich es bisher:
\documentclass{article}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{tikz}
\begin{document}
\[
E = \tikz [anchor=base, baseline] \node[circle,draw,color=red,text=black] {$mc^2$};
\]
\end{document}
![Formel mit Farbe][1]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/farbe-formel.png