Werden die Werte für `ytick` explizit angegeben, dann werden auch die `yminorticks` ebenfalls angezeigt:
angezeigt. Eine Höhenangabe ist hier nicht erforderlich.
\documentclass{standalone}
\usepackage{pgfplots}
\pgfplotsset{compat=newest}
\usepgfplotslibrary{dateplot}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}
\begin{semilogyaxis}[
clip=false,
width = \textwidth,
axis on top = true,
xmin = 2016-01-01,
xmax = 2021-12-31,
xtick = {2016-01-01, 2017-01-01, 2018-01-01, 2019-01-01, 2020-01-01, 2021-01-01},
xticklabel style ={/pgf/number format/1000 sep=,
xshift = 25pt},
ymin = 1E-14,
ymax = 1,
ylabel = {Wahrscheinlichkeit},
yminorticks = true,
ytick = {1E-13, 1E-12, 1E-11, 1E-10, 1E-09, 1E-08, 1E-07, 1E-06, 1E-05, 1E-04, 1E-03, 1E-02, 1E-01, 1}, % <=== Siehe hier
date coordinates in = x,
xticklabel=\year,
date ZERO = 2016-01-01
]
\addplot[blue, only marks, mark size = 0.5] coordinates {
(2016-03-04, 8.27e-11)
(2017-03-03, 3.30e-10)
(2018-01-15, 2.22e-10)
(2019-01-11, 2.47e-10)
(2020-01-13, 3.69e-10)
(2021-01-26, 2.55e-10)
};
\end{semilogyaxis}
\end{tikzpicture}
\end{document}
