Leider hast Du kein Minimalbeispiel angegeben, so dass wir nicht wissen, welches `beamertheme` Du nutzt. Für das Beispiel verwende ich jetzt mal `Copenhagen`, dass ohne Farbanpassung folgendes Ergebnis liefert:
![alt text][1]
Du kannst zum einen die Grundfarbe der Präsentation ändern, in dem Du das Farbthema `structure` mit einer entsprechenden Option lädst.
\documentclass{beamer}
\usetheme{Copenhagen}
\usepackage{lmodern}
\usecolortheme[named=gray]{structure}
\begin{document}
\section{ Abschnitt Test}
\begin{frame}
\begin{itemize}
\item Punkt
\begin{itemize}
\item Unterpunkt
\end{itemize}
\end{itemize}
\end{frame}!
\end{frame}
\end{document}
![alt text][2]
Mit `\setbeamercolor{<element>}{fg=<vordergrundfarbe>,bg=<Hintergrundfarbe>}` kannst Du die Farbe aber auch nur für ein ausgewähltes Element ändern, wie zum Beispiel die Aufzählungszeichen oder die Navigationssymbole:
\documentclass{beamer}
\usetheme{Copenhagen}
\usepackage{lmodern}
\setbeamercolor{item}{fg=gray}
\setbeamercolor{navigation symbols}{fg=gray}
\setbeamercolor{navigation symbols dimmed}{fg=gray}
\begin{document}
\section{ Abschnitt Test}
\begin{frame}
\begin{itemize}
\item Punkt
\begin{itemize}
\item Unterpunkt
\end{itemize}
\end{itemize}
\end{frame}
\end{document}
![alt text][3]
Wenn man einen Überblick über die Namen der schon definierten Farbelemente haben möchte, schaut man am besten in die Datei `beamercolorthemedefault.sty`.
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/beamerblau.png
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/beamergrau1.png
[3]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/beamergrau2.png