Hallo ! bin die Einträge nochmal durchgegangen und habe festgestellt, daß ich bei allen alphabetisch falsch plazierten Indexeinträgen jeweils ein Leerzeichen eingefügt hatte also
\index{ AMPA}
statt richtig:
\index{AMPA}
Das war die Erklärung für die falsche Sortierung der betreffenden Einträge.
Die allermeisten Indexeinträge hatte ich jedoch OHNE Leerzeichen getippt und nur die mit Leerzeichen wurden vor allen übrigen falsch im Index sortiert - im Beispiel Einträge von AMPA ... bis ... Tetrodotoxin.
also immer auf die Leezeichen achten - OHNE Leerzeichen bei den Indexbegriffen !!!!