Für die Farbe der Achsennummerierung:
xticklabel style=green,
und für die zugehörgen ticks:
xtick style=blue,style=blue,
![alt text][1]
\documentclass[margin=5mm]{standalone}
\usepackage{pgfplots}
\pgfplotsset{width=7cm,compat=newest}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}
\begin{axis}[
xlabel={$x$},
ylabel={$y$},
xticklabel style=green,
xtick style=blue,
]
\addplot[red]{x^2};
\end{axis}
\end{tikzpicture}
\end{document}
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/ticks.png