Mir Wenn ich Dich richtig verstehe, fragst Du danach, wie die Spektren unterschiedlich markiert können und wie die zusätzlichen Einträge gemacht werden können.
Standardmäßig werden mehrere Plots in einem Diagramm mit verschiedenen Farben und verschiedenen Markern dargestellt. Wenn der Datensatz eines Plotes aber viele Koordinaten enthält, dann stören die Marker schnell. Mit der Option `no markers` werden die Graphen nur noch verschieden farbig dargestellt. Alternativ kann man die Art der unterschiedlichen Markierung auch über die Option `cycle list name` einstellen (siehe [Dokumentation][1]).
Für die Beschriftung ist die Frage nicht ganz klar, aber vielleicht suchst es sicher sinnvoll sich einen Stil zu definieren. Ich gehe davon aus, dass du so etwas
die zusätzlichen Linien/Striche und Beschriftungen ähnlich zu deinem oberen Bild haben möchtest. Die Striche nach unten kannst du an den im `axis cs` angesteuerten Punkten durch `--+(<länge in x-richtung>,<länge in y-richtung>)` einzeichnen. Zu beachten ist, dass dabei die Längeneinheit mit angegeben werden muss.
\documentclass[margin=5mm]{standalone}
\usepackage{pgfplots}
\pgfplotsset{compat=newest}
\newcommand\laenge{-3ex}%
\newcommand\laenge{3ex}% Länge der Striche nach unten
\tikzset{
beschriftung/.style={
thick,pin edge=thick,
pin distance=\laenge,
gray,text=black
}
}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}
\begin{axis}
\begin{axis}[
%cycle list name=color list,
no markers
]
\addplot {x^2 - x +4};
\addplot {0.5*x^2 - x +4};
\begin{scope}[beschriftung]
\draw [thick,gray]
([yshift=\laenge]axis
([yshift=-\laenge]axis cs:-2,20)--
(axis cs:-2,20)--coordinate(a)(axis cs:-2,20)--
coordinate(a)(axis cs:3,20)
--+(0,\laenge)
(a)--+(0,\laenge);
node[at end,above,anchor=south east]{N I}
--+(0cm,-\laenge);
\draw(a)--+(0cm,-\laenge);
\node[coordinate,pin = {above:FI}] at (axis cs:4,23){};
\end{scope}
\end{axis}
\end{tikzpicture}
\end{document}
![alt text][1]
text][2]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/markierung.pnghttp://www.ctan.org/pkg/pgfplots
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/markierung_1.png
