Dein mit Option `handout` erstelltes PDF kannst Du beispielsweise mit [`pdfpages`](http://www.ctan.org/pkg/pdfpages) weiterverarbeiten. Mit [`eso-pic`](http://www.ctan.org/pkg/eso-pic) kannst Du dabei die Linien zusätzlich auf die Seiten bringen:
\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage{pdfpages}
\usepackage{eso-pic,picture}
\providecommand*{\vortrag}{meinvortrag.pdf}% HIER DEINE PDF-DATEI EINTRAGEN!
\begin{document}
\AddToShipoutPicture{%
\AtPageUpperLeft{%
\multiput(.65\paperwidth,-2cm)(0,-.5cm){15}{\line(1,0){.3\paperwidth}}
\multiput(.65\paperwidth,-.38\paperheight)(0,-.5cm){15}{\line(1,0){.3\paperwidth}}
\multiput(.65\paperwidth,-.7\paperheight)(0,-.5cm){15}{\line(1,0){.3\paperwidth}}
}%
}
\includepdf[pages=-,nup=1x3,frame,offset=-3cm 0cm,scale=.9,delta=1cm 1cm]{\vortrag}
\end{document}
Die Anweisungen `\multiput` und `\line` sind Standard-LaTeX-Anweisungen, die in jeder ausführlichen LaTeX-Einführung zu finden sind. Das Paket [`picture`](http://www.ctan.org/pkg/picture) verwende ist hier nur, um direkt Längen statt Vielfache von `\unitlength` in den Argumenten dieser Befehle verwenden zu können.
Statt mit `eso-pic` und den genannten `picture`-Befehlen, kann man die Linien natürlich auch mit [`TikZ`](http://www.ctan.org/pkg/pgf) machen. Erschien mir in diesem Fall aber übertrieben. Die verwendete Optionen von `\includepdf` sind in der Anleitung von `pdfpages` bzw. in der [`graphicx`](http://www.ctan.org/pkg/graphics)-Anleitung erklärt.
Statt handschriftlicher Notizen könnte man die Notizen natürlich ebenfalls mit LaTeX erstellen. In dem Fall wäre folgende Definition einer Umgebung nützlich:
\newcounter{hpage}
\newenvironment{hpage}[1][1]{%
\parfillskip=0pt
\minipage{\textwidth}
\addtocounter{hpage}{#1}%
\raisebox{\dimexpr\ht\strutbox-\totalheight\relax}{%
\frame{\includegraphics[page=\value{hpage},width=.45\linewidth]{\vortrag}}%
}\hfill
\minipage[t]{.5\textwidth}
}{%
\endminipage
\endminipage\par
}
Verwenden könnte man diese dann beispielsweise so:
\begin{hpage}[2]% Seite 2 des Vortrags anzeigen
Dieser Text steht dann rechts neben dem Abbild der Seite.
\end{hpage}
\begin{hpage}% nächste Seite, also Seite 3 des Vortrags anzeigen
Dieser Text steht dann rechts neben der dritten Seite des Vortrags.
\end{hpage}
\begin{hpage}[2]% übernächste Seite, also Seite 5 des Vortrags anzeigen
Dieser Text steht dann rechts neben dem Abbild der Seite.
\end{hpage}
