Unabhängig davon, ob man KOMA-Script verwendet oder nicht, bietet das Paket `biblatex` dafür die Option `headings=numbered`:
`headings=bibnumbered`:
\documentclass[12pt]{scrreprt}
% \documentclass[12pt]{report}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[ngerman]{babel}
% Literaturverzeichnis & Co. -----------------------------------------------------------------------
\usepackage{csquotes}
\usepackage[style=apa,sortcites=true,sorting=nyt,backend=biber]{biblatex}
\DeclareLanguageMapping{german}{german-apa}
\usepackage{blindtext}
\begin{filecontents}{\jobname.bib}
@Book{Goossens1994,
author = {Goossens, Michel and Mittelbach,
Frank and Samarin, Alexander},
title = {The LaTeX Companion},
publisher = {Addison-Wesley},
location = {Reading, Mass.},
year = {1994},
}
\end{filecontents}
\addbibresource{\jobname.bib}
\begin{document}
\tableofcontents
\chapter{Kapitel Eins}
\blindtext
\Textcite{Goossens1994}
\printbibliography[heading=bibnumbered]
\end{document}
Weitere mögliche Einstellungen der Option `headings` sind in der deutschen `biblatex`-Anleitung unter »Bibliografieüberschriften und Umgebungen« und in der englischen Anleitung unter »Bibliography Headings and Environments« zu finden.finden. Dabei sind auch Einstellungen für *Unterüberschriften*.