Der vertikale Abstand innerhalb von Matheumgebungen für mehrere Zeilen wird über die Länge `\jot` gesteuert, deren Voreinstellung `3pt` ist. Das kann man übrigens ebenfalls in [Math Mode][1] nachlesen.
\documentclass{article}
\usepackage{amsmath}
\begin{document}
\begin{align}
a + b &= c \\
a + b &= c \\
a + b &= c
\end{align}
\setlength\jot{1cm}
\begin{align}
a + b &= c \\
a + b &= c \\
a + b &= c
\end{align}
\end{document}
![alt text][2]
Für Matheumgebungen, die auf der `array` Umgebung aufbauen, definiert man am besten `\arraystretch` neu, dessen voreingestellter Wert 1 ist.
\renewcommand\arraystretch{1.3}
Beide Längen wirken übrigens global.
[1]: http://texdoc.net/pkg/mathmode
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/jot.png
