Keine Antwort aber auch zu lange für einen Kommentar:
statt `\usepackage[multiple]{footmisc}` würde ich an Deiner Stelle die KOMA-Script-Option `footnotes=multiple` verwenden. Dann kannst Du auch mit `\deffootnote` die Fußnoten so definieren, dass Du Dir den expliziten Weißraum vor `Vgl.` in `\footcite[ Vgl.][S.~58--67]{angenendt}` sparen kannst (übrigens: *zwei* Leerzeichen sind hier eh nutzlos, da sie zu einem zusammengefasst werden), z.B. mit
\deffootnote[1.5em]{1.5em}{1em}{\makebox[1em][l]{\textsuperscript{\thefootnotemark}}}
Des weiteren kannst Du Dir das Eintippen von `S.~` sparen: `biblatex` erkennt von selbst, dass es sich hier um Seitenzahlen handelt. Also: `\footcite[Vgl.][58--67]{angenendt}`
\documentclass[
a4paper,11pt,
headsepline=0.5pt ,
headings=small,
toc=bibliography,
footnotes=multiple % <<<<
]{scrreprt}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[babel, german=quotes]{csquotes}
\usepackage{scrlayer-scrpage}
% so definiert, dass ein Abstand zwischen Marke und Note bleibt
\deffootnote[1.5em]{1.5em}{1em}{\makebox[1em][l]{\textsuperscript\thefootnotemark}}
\deffootnote[1.5em]{1.5em}{1em}{\makebox[1em][l]{\textsuperscript{\thefootnotemark}}}
\usepackage[
backend=biber,
style=authoryear,
isbn=false,
autocite=footnote,
]{biblatex}
\setlength{\bibitemsep}{1em}
\setlength{\bibhang}{1em}
\addbibresource{biblatex-examples.bib}
\begin{document}
\chapter{Begriffliche und großartige Grundlagen}
\section{Grundlagen und ausgewählte bla bla nurma pompilus}
Der Strategiebegriff wird bla bla bla\footcite[Vgl.][58--67]{angenendt}
Als Vertreter\footcite[Vgl.][58--67]{aristotle:anima} Auch wenn bla
bla\footcite[Vgl.][27--28]{augustine} sind es bla bla die bla.
bla\footnote{blub}\footnote{blubber}% <<<< funktioniert!
\printbibliography
\end{document}
![alt text][1]
![alt text][2]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/footnote.png
[2]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/footnote2.png
