Ich empfehle für die Subfiguren Gebilde mit Koordinaten zu verwenden. <br> Da sich TikZ-Matrizen scheints nicht in andere TikZ-Matrizen nesten lassen, muss man sich sowas selbst erstellen:
\newcommand{\mysubfigure}[1]{%%%%
\node{}; % Will er unbedingt
\foreach \y in {1,...,\Rows}
\foreach \x in {1,...,\Cols}
\node[draw,
fill=lightgray, font=\tiny, %thin,
xshift=\x*\width cm, cm-1cm, yshift=-\y*\height cm+1cm, % verbessert²
minimum width=\width cm, minimum height=\height cm] (#1-\y-\x) {
\ifnum\BeschriftungAnzeigen=1 #1:\y,\x \else\fi};
}%%%%
Damit sind die Pfeile dann kein Problem <br>`\draw[Pfeil] (I-1-3) -- (J-1-1);
\draw[Pfeil] (E-1-3.east) -- ([xshift=1em]E-1-3.east) -- ([xshift=-1em]B-1-1.west) -- (B-1-1.west);` <br>
usw.
[![alt text][1]][2]
Mit der Einstellung `\def\BeschriftungAnzeigen{0}`
[![alt text][3]][3]
**(Bilder hochladen geht hier nicht, also als googledrive-Link. Ob das so gedacht ist? Vermutlich nicht....)**
\documentclass[tikz]{standalone}
\usetikzlibrary{matrix}
\begin{document}
\pgfmathtruncatemacro\Rows{4} % Number of lines
\pgfmathtruncatemacro\Cols{3} % Number of columns
\def\height {1.0} %height
\def\width {1.0} %width
\def\BeschriftungAnzeigen{1} % 1 0
\newcommand{\mysubfigure}[1]{%%%%
\node{}; % Will er unbedingt
\foreach \y in {1,...,\Rows}
\foreach \x in {1,...,\Cols}
\node[draw,
fill=lightgray, font=\tiny, %thin,
xshift=\x*\width cm, yshift=-\y*\height cm,
minimum width=\width cm, minimum height=\height cm] (#1-\y-\x) {
\ifnum\BeschriftungAnzeigen=1 #1:\y,\x \else\fi};
}%%%%
\begin{tikzpicture}
\matrix [matrix of nodes, nodes in empty cells,
%ampersand replacement=\&,
column sep=1cm,row sep=1cm] (ae) {
\mysubfigure{A} & \mysubfigure{B} & \mysubfigure{C} & \mysubfigure{D} \\
\mysubfigure{E} & \mysubfigure{F} & \mysubfigure{G} & \mysubfigure{H} \\
\mysubfigure{I} & \mysubfigure{J} & \mysubfigure{K} & \mysubfigure{L} \\
%\myfigure & \myfigure & \myfigure & \myfigure & \\
};
% Pfeile
\tikzset{Pfeil/.style={->, rounded corners, thick}}
\draw[Pfeil] (A-1-3.east) -- ([xshift=1em]A-1-3.east) -- ([xshift=-1em]F-1-1.west) -- (F-1-1.west);
\draw[Pfeil] (E-1-3.east) -- ([xshift=1em]E-1-3.east) -- ([xshift=-1em]B-1-1.west) -- (B-1-1.west);
\draw[Pfeil] (I-1-3) -- (J-1-1);
\draw[Pfeil] (J-1-3.east) -- ([xshift=1em]J-1-3.east) -- ([xshift=-1em]G-1-1.west) -- (G-1-1.west);
\draw[Pfeil] (K-1-3.east) -- ([xshift=1em]K-1-3.east) -- ([xshift=-1em]D-1-1.west) -- (D-1-1.west);
% ....
\end{tikzpicture}
\end{document}
[1]: https://drive.google.com/uc?id=1qbLnhUgcyL97E1jYhtGIbMR4ZR-UE7RS
[2]: https://drive.google.com/uc?id=1qbLnhUgcyL97E1jYhtGIbMR4ZR-UE7RS
[3]: https://drive.google.com/uc?id=1IwccMnzZjgEwebeiibAVFEnebVzu9_k6