Bei texworks (v. 0.5r1031) versteckt sich der Schalter für die Eingabekodierung in `bearbeiten -> Einstellungen` im Bereich Editor. In der Statusleiste am unteren Rand kann man die aktuelle Kodierung des Dokumentes auch sofort ablesen.
![texworks][1]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/texworks.png