Da `beamer` im gezeigten Beispiel sowohl für die Folien als auch die Notizen `pdfpages` verwendet und dabei wie @Ulrike Fischer korrekt bemerkt hat, laut Dokumentation nicht nur Links sondern auch die Position der Eingabefelder verloren geht, kann man das leider nicht über Formularfelder realisieren.
Eine Möglichkeit bestünde aber darin, nicht den `handout` Modus von `beamer` zu verwenden, sondern ein Zweitdokument anzulegen. Dabei kann man dann die vorhandenen Folien per `\includegraphics` aus dem Präsentations-PDF laden und daneben tatsächlich ein Notizfeld anlegen. Man hat also einerseits ein Dokument `test-presentation.tex`:
\documentclass[12pt]{beamer}
\usetheme{Berlin}
\title{Test title}
\author [X.Y.] {X Y}
\date [November 2013] {November 9, 2013}
\begin{document}
\begin{frame}[plain,noframenumbering]
\titlepage
\end{frame}
\begin{frame}{Overview}
\tableofcontents
\end{frame}
\section{Section 1}
\begin{frame}[t]{Frame 1}
\end{frame}
\end{document}
Und ein zweites Dokument `handout.tex`:
%!TeX None
% Da dieses Dokument im Online-Compile ohne das Ergebnis aus dem vorherigen
% nicht funktioniert, habe ich die Verwendung des Online-Compilers mit der
% ersten Kommentarzeile deaktiviert.
\documentclass[DIV=20]{scrartcl}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{hyperref}
\newcommand*{\FrameAndNote}[1]{%
\par
\noindent
\raisebox{-\totalheight}{%
\includegraphics[page=#1,width=.5\linewidth]{presentation.pdf}%
}\hfill
\begin{minipage}[t]{.45\linewidth}
\raggedright
Note:
\medskip
\TextField[multiline,width=\linewidth,height=.2\textheight]{}
\end{minipage}\par
}
\begin{document}
\begin{Form}
\FrameAndNote{1}
\FrameAndNote{2}
\FrameAndNote{3}
\end{Form}
\end{document}
Nun erzeugt man zuerst `presentation.pdf` aus dem ersten Dokument und verwendet dann das zweite für das Handout mit funktionierenden Formularfeldern für die Notizen.
Prinzipiell könnte man das natürlich auch wahlweise mit einem externen Prozessor wie [`arara`](https://www.ctan.org/pkg/arara) oder per [shell escape](https://texwelt.de/fragen/10341) automatisieren:
%!TeX None
% Da diese Möglichkeit danach verlangt, pdflatex with option --shell-escape
% aufzurufen, funktioniert dieses Beispiel nicht im Online-Compiler. Daher
% habe ich dessen Verwendung mit der ersten Kommentarzeile deaktiviert.
\begin{filecontents}[force]{\jobname-presentation.tex}
\documentclass[12pt]{beamer}
\usetheme{Berlin}
\title{Test title}
\author [X.Y.] {X Y}
\date [November 2013] {November 9, 2013}
\begin{document}
\begin{frame}[plain,noframenumbering]
\titlepage
\end{frame}
\begin{frame}{Overview}
\tableofcontents
\end{frame}
\section{Section 1}
\begin{frame}[t]{Frame 1}
\end{frame}
\end{document}
\end{filecontents}
\documentclass[DIV=20]{scrartcl}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{hyperref}
\usepackage{shellesc}
\newcommand*{\FrameAndNote}[1]{%
\par
\noindent
\raisebox{-\totalheight}{%
\includegraphics[page=#1,width=.5\linewidth]{\jobname-presentation.pdf}%
}\hfill
\begin{minipage}[t]{.45\linewidth}
\raggedright
Note:
\medskip
\TextField[multiline,width=\linewidth,height=.2\textheight]{}
\end{minipage}\par
}
\ShellEscape{pdflatex \jobname-presentation.tex}
\ShellEscape{pdflatex \jobname-presentation.tex}
\begin{document}
\begin{Form}
\FrameAndNote{1}
\FrameAndNote{2}
\FrameAndNote{3}
\end{Form}
\end{document}
Natürlich ist so ein Vorgehen weniger komfortabel als die Verwendung des `handout`-Modus von `beamer`.
Einfacher geht allerdings, wäre daher, wie @Ulrike Fischer in einem Kommentar erwähnt hat, dass man den Studenten erklärt, wie die Kommentarfunktion der meisten PDF-Reader funktioniert. Dann können sie die Notizen einfach darüber einfügen. Dann kann man auch wieder die `handout`-Funktion von `beamer` mit ihrem ganzen Komfort verwenden. Darüber hinaus hat die Kommentarfunktion der PDF-Reader den Vorteil, dass man Kommentare nicht nur an einem festen Platz einfügen und unterschiedliche Farben und zusätzlich Striche oder Textmarkerfunktionen etc. nutzen kann. Es lohnt sich also durchaus, den Umgang damit zu erlernen.