Du denkst viel zu kompliziert. Da du ohnehin weißt, dass du mit `chapterprefix` arbeitest, ist die Grundidee einfach:
\documentclass[chapterprefix]{scrbook}
\usepackage{blindtext}
\renewcommand*{\chapterformat}{%
\chapapp~\makebox[0pt][l]{\hspace{\marginparsep}\thechapter\autodot}%
}
\let\raggedchapter\raggedleft% → https://sourceforge.net/p/koma-script/wiki-de/HowTo_CenterHeading/
\begin{document}
\frontmatter
\tableofcontents
\mainmatter
\blinddocument
\end{document}
Das ist prinzipiell also genau der Trick, der schon in [Wie die Überschriftennummern in den linken Rand ausgerückt werden können](https://sourceforge.net/p/koma-script/wiki-de/HowTo_NumbersAtLeftMargin/) verwendet wird. Insbesondere muss man kein `\chapterlineswithprefixformat` umdefinieren. Die generelle Größe der Prefixzeile kann man dann mit `\setkomafont` verändern. Will man einen eigenen Font für die Nummer, kann man dafür sogar ein eigenes Element definieren:
\documentclass[chapterprefix]{scrbook}
\usepackage{blindtext}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}% Wir brauchen eine skalierbare Schrift
Schrift → https://texwelt.de/fragen/15931
\setkomafont{chapterprefix}{\large}
\newkomafont{chapternumber}{\fontsize{64}{72}\selectfont}
\renewcommand*{\chapterformat}{%
\chapapp~\makebox[0pt][l]{\hspace{\marginparsep}\usekomafont{chapternumber}{\thechapter\autodot}}%
}
\let\raggedchapter\raggedleft
\let\raggedchapter\raggedleft% → https://sourceforge.net/p/koma-script/wiki-de/HowTo_CenterHeading/
\begin{document}
\frontmatter
\tableofcontents
\mainmatter
\blinddocument
\end{document}
und wenn man jetzt noch die schwarze Randmarkierung haben will:
\documentclass[
chapterprefix,
]{scrbook}
\documentclass[chapterprefix]{scrbook}
\usepackage{blindtext}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{lmodern}% Wir brauchen eine skalierbare Schrift
Schrift → https://texwelt.de/fragen/15931
\setkomafont{chapterprefix}{\large}
\newkomafont{chapternumber}{\fontsize{64}{72}\selectfont}
\newlength{\oddrightmargin}
\AfterCalculatingTypearea{%
\setlength{\oddrightmargin}{\dimexpr \paperwidth
-1in - \oddsidemargin - \textwidth\relax}%
}
\recalctypearea
\renewcommand*{\chapterformat}{%
\chapapp~\makebox[0pt][l]{%
\makebox[\oddrightmargin][l]{%
\hspace{\marginparsep}%
\usekomafont{chapternumber}{%
\thechapter\autodot
\hfill\rule{\ht\strutbox}{\ht\strutbox}\hskip-5mm%
}%
}%
}%
}
\let\raggedchapter\raggedleft
\let\raggedchapter\raggedleft% → https://sourceforge.net/p/koma-script/wiki-de/HowTo_CenterHeading/
\begin{document}
\frontmatter
\tableofcontents
\mainmatter
\blinddocument
\end{document}
Es ist übrigens Absicht, dass die schwarze Box 5mm über den rechten Rand hinaus ragt. Wie der KOMA-Script-Autor irgendwo bei seinen Beispielen mit solchen Boxen erklärt, sollte man nämlich sogenanntes randabfallendes Material immer überstehen lassen, damit beim Schneiden und Binden nicht versehentlich doch eine weiße Linie entsteht.
Wie man sieht, ist das mit KOMA-Script kein Hexenwerk, sondern recht einfaches Hantieren mit Boxen.