Man kann die Nummern der Gleichungen, die man nicht nummeriert haben will, mit `\notag` oder `\nonumber` unterdrücken:
    \documentclass{article}
    \usepackage{amsmath}
    \begin{document}
    \begin{align}
        a + b +c &= X \notag \\
        a +b &= X - c \notag \\
        a &= X - c -b 
    \end{align}
    \begin{align}
        a + b +c &= X \nonumber \\
        a +b &= X - c \nonumber \\
        a &= X - c -b 
    \end{align}
    \end{document}
![alt text][1]
Alternativ kann man `align*` verwenden und sich ein `\numbereq` definieren:
    \documentclass{article}
    \usepackage{amsmath}
    \makeatletter
    \newcommand\numberthis{%
\newcommand\numbereq{%
      \ifmeasuring@\else
        \refstepcounter{equation}%
      \fi
      \tag{\theequation}%
    }
    \makeatother
    \begin{document}
    \begin{align*}
        a + b +c &= X  \\
        a +b &= X - c  \\
        a &= X - c -b \numbereq
    \end{align*}
    \end{document}
<sub>Ich bin unsicher, ob `\ifmeasuring@` hier wirklich nötig ist. Es scheint jedenfalls nichts zu schaden. `\ifmeasuring@` ist in `amsmath`s Umgebungen wahr, wenn der Platzbedarf für die Gleichungen bestimmt wird, und falsch, wenn das eigentliche Setzen stattfindet.</sub>
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Will man grundsätzlich nur referenzierte Gleichungen nummerieren (aus welchen Gründen auch immer), dann kann man das Paket [`autonum`][2] verwenden:
    \documentclass{article}
    \usepackage{amsmath}
    \usepackage{autonum}
    \begin{document}
    \begin{align}
        a + b +c &= X  \\
        a +b &= X - c  \\
        a &= X - c -b \label{eq:ergebnis}
    \end{align}
    Siehe Gleichung~\eqref{eq:ergebnis}.
    \end{document}
![alt text][3]
  [1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/notag.png
  [2]: http://www.ctan.org/pkg/autonum
  [3]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/autonum.png