Da ist ledigllich dein erster `dot` ein wenig fehl am Platze.
Kennst du das Paket `physics`? Damit kannst du das etwas übersichtlicher darstellen.
\documentclass{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{physics}
\begin{document}
\begin{equation}
\left(
\frac{\partial\dot{L}}
{\partial\dot{\varphi}}
\right) \quad
\left(
\pdv{\dot{L}}{\dot{\varphi}}
\right)
\end{equation}
\end{document}\end{document}
![alt text][1]
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/theburied.png