Habe meinen Fehler gefunden.
Ich habe den Style der lstlistinput `\lstinputlisting` angepasst und in der
lstdefinestyle `\lstdefinestyle` hatte ich
<pre><code>
\lstdefinestyle{mystyle}{
...
mathescape=true,
...
</code></pre>
Ich bin mir momentan gar nicht sicher, warum ich das da drin habe und ob ich es brauche. Jedenfalls verursacht das den Fehler. Habe es auf false `false` gesetzt, bzw. auskommentiert.