Dazu musst Du nur noch ein `anchor=north` mit angeben, damit TikZ weiß, wo verankert werden soll.
\documentclass{article}
\usepackage{tikz-qtree}
\newcommand*{\knoten}[1]{\tikz\node[draw,thick,rounded corners,
fill=yellow!15,inner sep=.8ex]{#1};}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}[every tree node/.style={align=center,anchor=north}]
\Tree
[.{\knoten{Gruppieren in \TeX}}
[.{\knoten{{$\mathtt{\{}$} \ldots\ $\mathtt{\}}$}} ]
[.{\knoten{\texttt{\char`\\ begingroup} \\ \ldots \\ \texttt{\char`\\ endgroup}}} ]
[.{\knoten{\texttt{\char`\\ bgroup} \\ \ldots \\ \texttt{\char`\\ egroup}}} ]]
\end{tikzpicture}
\end{document}
![alt text][1]
![Ausgabe des Dokuments][1]
[1]: http://i.imgur.com/2u0FG2M.png/upfiles/balancierter-baum.png