\usepackage{fancyhdr} ersetzen durch KOMA-Klasse \usepackage[...]{scrlayer-scrpage}

%% --- Sprache und Textcodierung -----------------------------
 % deutsche Beschriftungen (z.B. "Inhaltsverzeichnis), Umlaute, Anführungszeichen, Silbentrennung:
\usepackage[english, ngerman]{babel}
% Choose an output font encoding that has support for the accented characters used by the most widespread European languages (German, French, Italian, Polish and others), which is important because otherwise TeX would not correctly hyphenate words containing accented letters:
\usepackage[T1]{fontenc}
% Zeichencodierung der tex-Dateien (Format):
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[right]{eurosym} % fuer das Euro-Symbol (\euro{} oder \EUR{51.13})

%% --- Seiteneinstellungen -----------------------------
%\usepackage{anysize} % simple package to set up document margins
\usepackage[a4paper]{geometry} % Paket zum Einstellen der Seitenränder
% Seitenränder:
\newgeometry{left=30mm, right=20mm, top=18mm, bottom=16mm,includeheadfoot}
% Zeilenabstand
\usepackage{setspace} % set space between lines
\onehalfspacing
%\linespread{1.1} %ebenfalls Zeilenabstand. Aber nicht so zu empfehlen
\setlength{\parskip}{6pt} %Abstand zwischen zwei Absätzen (Blöcken)
% Zeilenabstände bei den Überschriften
% Siehe: http://golatex.de/abstaende-vor-und-nach-ueberschriften-t15446.html
% Siehe auch Doku der Koma-Scriptklasse
% baselineskip: Zeilenabstand innerhalb eines Absatzes
\RedeclareSectionCommand[
  beforeskip=15pt, % Der Betrag gibt den vertikalen Abstand vor der Überschrift an. Ist der Wert negativ, so wird also trotzdem ein positiver Abstand eingefügt. Negative Werte bedeuten in diesem Fall, dass der Absatz nach der Überschrift ohne horizontalen Einzug gesetzt werden soll.
  afterskip=10pt % Der Betrag gibt den vertikalen Abstand nach der Überschrift an. Muss immer > 0 sein, da Latex sonst mist macht
  ]{chapter}
\RedeclareSectionCommand[
  beforeskip=-15pt, % Der Betrag gibt den vertikalen Abstand vor der Überschrift an. Ist der Wert negativ, so wird also trotzdem ein positiver Abstand eingefügt. Negative Werte bedeuten in diesem Fall, dass der Absatz nach der Überschrift ohne horizontalen Einzug gesetzt werden soll.
  afterskip=8pt  % Ein negativer Wert bedeutet, dass die Überschrift als Spitzmarke formatiert werden soll. Der Betrag gibt dabei den horizontalen Abstand nach der Über- schrift an. Ein positiver Wert führt hingegen zu ei- nem vertikalen Abstand nach der Überschrift.
  ]{section}
\RedeclareSectionCommand[
  beforeskip=-8pt,
  afterskip=1pt]{subsection}
\RedeclareSectionCommand[
  beforeskip=-4pt,
  afterskip=1pt]{subsubsection}

%% --- Fußnoten -----------------------------------
% Fußnoten sollen durchgängig nummeriert sein. Die Nummerierung soll nicht
% bei jedem Kapitel wieder von vorne beginnen:
% Quelle: http://www.golatex.de/nummerierung-der-fussnoten-durchgehend-im-gesamten-dokument-t2042.html
\usepackage{remreset} 
\makeatletter 
\@removefromreset{footnote}{chapter} 
\makeatother

%% --- Typographie -----------------------------
%\usepackage{ae}   
%\usepackage[bitstream-charter]{mathdesign}
\usepackage{libertine} % font with serif
%\usepackage{arev} % font sans serif
\usepackage[scaled]{helvet} % sans serif für Deckblatt

% Zwischengrößen für die Schriftgröße (für das Deckblatt):
\makeatletter
\newcommand\semiHuge{\@setfontsize\semiHuge{22.72}{27.38}} 
\makeatother

% Optischer Randausgleich:
% Beispiel: Kommata am Spaltenrand: Hier ist die gleichmäßige Schwärzung des Textblocks durchbrochen, weil für einen Trennstrich o. ä. nicht so viel Druckerschwärze aufs Papier kommt. Optischer Randausgleich bedeutet, hier einen ausgeglicheneren Eindruck zu schaffen, indem Trennstriche usw. ein wenig über den Spaltenrand hinaus gesetzt werden. 
\usepackage[activate]{pdfcprot}
%\usepackage{xcolor}  % farbiger Text möglich, x = mehr Farben

% Schalte auf eine grosszuegige Formatierungsweise um,
% die relativ wenige Worttrennungen am Zeilenende erzeugt,
% dafür aber auch etwas größere Wortabstände innerhalb der Zeilen
% zuläßt:
\sloppy

% Schriftgrößen der Überschriften:
%\setkomafont{chapter}{\large}
%\setkomafont{section}{\normalfont\bfseries}
%\setkomafont{subsection}{\normalfont\itshape}
%\setkomafont{subsubsection}{\normalfont\itshape}

% Schriftfarben (siehe https://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Colors):
\usepackage[usenames,dvipsnames,svgnames,table]{xcolor}

%% --- Konzeptausdruck & Testing -----------------------------
%\setstretch{2.0} % fuer die Korrektur weiterer Zeilenabstand
%Wasserzeichen für den Konzeptausdruck:
%\usepackage{draftwatermark}
% Show black rectangles where overfull hboxes occur - used for "debugging":
%\overfullrule=5pt

%% --- Grafiken & Abbildungen -----------------------------
\usepackage[pdftex]{graphicx} %%Grafiken in pdfLaTeX
\DeclareGraphicsExtensions{.pdf,.jpg,.png}
\usepackage[font=small,labelfont=bf]{caption} % "Abbildung X" fett machen
\usepackage{subfigure} %Paket, um zwei Bilder nebeneinander anzeigen zu können
\usepackage{float} % um den H-Befehl anwenden zu können, Bild HIER zu positionieren
%\usepackage{afterpage} % setzt bei Angabe von \afterpage{\clearpage} alle ausstehenden Bilder, etc. auf die Seite, ohne jedoch an der Stelle wie \clearpage einen Seitenumbruch zu bewirken.
\usepackage{blindtext} % generates dummy text/blindtext

%% --- Tabellen -----------------------------
% allows to write tables that continue to the next page. See: http://mirrors.ctan.org/macros/latex/required/tools/longtable.pdf
\usepackage{longtable}
% An extended implementation of the array and tabular environments which extends the options for column formats, and provides "programmable" format specifications. See: http://mirrors.ctan.org/macros/latex/required/tools/array.pdf
\usepackage{array}
% Better horizontal lines in tabulars and arrays to specify what happens when a horizontal line meets a vertical line. Use \hline
% See: https://www.ctan.org/pkg/hhline
\usepackage{hhline}

%% --- Formeln ---------------------------------------------
% siehe: https://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Mathematics
\usepackage{mathtools}
\usepackage{xfrac}  % schönere Bruchdarstellung im Text mit $\sfrac{1}{2}$
\usepackage[version=3]{mhchem} % fuer chemische Summenformeln. Bsp: \ce{H2O}

%% --- Aufzählungen ---------------------------------------------
\usepackage{mdwlist} %Ermöglicht itemize* für kompaktere Aufzählung

%% --- Hyperlinks ---------------------------------------------
% http://www.tex.ac.uk/cgi-bin/texfaq2html?label=pdfpagelabels
% Doku zu hyperref:
% https://en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Hyperlinks
% http://www.tug.org/applications/hyperref/ftp/doc/manual.pdf
% http://wiki.lyx.org/FAQ/PDF#toc6
\usepackage
[
bookmarks,              % show the bookmarks bar when displaying the document
hidelinks,              % hide links (removing color and border)
% Metadaten für das pdf-Dokument:
pdftitle={Masterarbeit},
pdfauthor={XXX}
] {hyperref}

%% --- Kopf- und Fußzeile ---------------------------------------------
\usepackage{fancyhdr} % Paket zur Manipulation von Kopf- und Fußzeile
\pagestyle{fancy}     % eigene Definition der Kopf- und Fußzeile

%Spezielle Formatierung der Kapitelseiten:
%\chapter und \maketitle rufen automatisch \thispagestyle{plain} auf
%->also umdefinieren
\fancypagestyle{plain}{
    \fancyhf{}
    \fancyhead{} % clear all header fields
    \chead{}
    \lhead{}
    \rhead{\thepage}
    \renewcommand{\headrulewidth}{0.5pt}
    \renewcommand{\footrulewidth}{0pt}
}
% Fancyhdr ersetzt durch \usepackage[automark,headsepline]{scrlayer-scrpage}

%\usepackage[automark,headsepline]{scrlayer-scrpage}
%\clearpairofpagestyles
%\cfoot[\pagemark]{\pagemark}
%\lehead{\headmark}
%\rohead{\headmark}
%\pagestyle{scrheadings}
% Noch zu bearbeiten!

\fancyhf{} %alle Kopf- und Fu§zeilenfelder bereinigen
%Der Kopfzeilenbereich:
%Fuer den Kopzeilenbereich Ungerader Seitenzahlen (Odd). Aktiv nur bei doublepage!
\fancyhead[OL]{\nouppercase{\leftmark}} %Kopfzeile links
\fancyhead[OC]{}                        %zentrierte Kopfzeile
\fancyhead[OR]{\thepage}                %Kopfzeile rechts
%Fuer den Kopzeilenbereich gerader Seitenzahlen (Even)  und immer bei onepage
\fancyhead[EL]{\thepage}                %Kopfzeile links
\fancyhead[EC]{}                        %zentrierte Kopfzeile
\fancyhead[ER]{\nouppercase{\leftmark}} %Kopfzeile rechts
%Fandyhf ersetzt durch \usepackage[automark,headsepline]{scrlayer-scrpage}